舘ひろしと柴田恭兵が主演した人気ドラマ『あぶない刑事』の映画版シリーズ第2作。名コンビ、タカとユージは、ベイシティ横浜を牛耳ろうとする若きフィクサーに挑戦する。
横浜港署捜査課の刑事コンビ、鷹山と大下は、横浜を陰から牛耳ろうとする若きフィクサー長峰の内偵を開始。長峰は手下の麻薬密売人が鷹山たちに逮捕された直後、顧問弁護士に密売人を釈放させるが、密売人は結局何者かに射殺されてしまう。そんな長峰は政界に対して圧力をかけ、国家機密法案を成立させようとたくらんでいたが、邪魔に入った鷹山たちの買収を策略。そこで調子のいい鷹山と大下は、大金の誘惑につられそうになるが？